Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LtbrP50284 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LtbrP50284 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LtbrP50284 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LtbrP50284 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LtbrP50284 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LtbrP50284 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LtbrP50284 Gm11569-201ENSMUST00000105057 869 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LtbrP50284 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LtbrP50284 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LtbrP50284 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LtbrP50284 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LtbrP50284 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LtbrP50284 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LtbrP50284 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LtbrP50284 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LtbrP50284 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LtbrP50284 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LtbrP50284 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LtbrP50284 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LtbrP50284 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LtbrP50284 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LtbrP50284 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LtbrP50284 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LtbrP50284 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LtbrP50284 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LtbrP50284 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LtbrP50284 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LtbrP50284 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LtbrP50284 Gm9519-201ENSMUST00000206108 1337 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LtbrP50284 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LtbrP50284 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LtbrP50284 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LtbrP50284 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LtbrP50284 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LtbrP50284 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LtbrP50284 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LtbrP50284 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LtbrP50284 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LtbrP50284 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LtbrP50284 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LtbrP50284 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LtbrP50284 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LtbrP50284 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LtbrP50284 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LtbrP50284 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LtbrP50284 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LtbrP50284 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LtbrP50284 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LtbrP50284 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LtbrP50284 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LtbrP50284 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LtbrP50284 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LtbrP50284 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LtbrP50284 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LtbrP50284 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LtbrP50284 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LtbrP50284 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LtbrP50284 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LtbrP50284 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LtbrP50284 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LtbrP50284 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LtbrP50284 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LtbrP50284 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LtbrP50284 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LtbrP50284 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LtbrP50284 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LtbrP50284 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LtbrP50284 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LtbrP50284 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LtbrP50284 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LtbrP50284 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LtbrP50284 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LtbrP50284 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LtbrP50284 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LtbrP50284 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LtbrP50284 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LtbrP50284 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LtbrP50284 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LtbrP50284 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LtbrP50284 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LtbrP50284 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LtbrP50284 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LtbrP50284 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LtbrP50284 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LtbrP50284 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LtbrP50284 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LtbrP50284 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LtbrP50284 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LtbrP50284 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LtbrP50284 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LtbrP50284 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LtbrP50284 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LtbrP50284 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LtbrP50284 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LtbrP50284 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LtbrP50284 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LtbrP50284 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LtbrP50284 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LtbrP50284 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms