Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Tmod1P49813 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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