Protein–RNA interactions for Protein: P49769

Psen1, Presenilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psen1P49769 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Psen1P49769 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Psen1P49769 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Psen1P49769 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Psen1P49769 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Psen1P49769 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Psen1P49769 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Psen1P49769 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Psen1P49769 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Psen1P49769 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Psen1P49769 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Psen1P49769 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Psen1P49769 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Psen1P49769 Gm15171-201ENSMUST00000122191 334 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Psen1P49769 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Psen1P49769 Gm15787-203ENSMUST00000130892 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Psen1P49769 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Psen1P49769 Gm40263-201ENSMUST00000197468 580 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Psen1P49769 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Psen1P49769 Cnot2-201ENSMUST00000020374 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Psen1P49769 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Psen1P49769 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Psen1P49769 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Psen1P49769 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Psen1P49769 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Psen1P49769 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Psen1P49769 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Psen1P49769 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Psen1P49769 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Psen1P49769 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Psen1P49769 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Psen1P49769 Gm8872-201ENSMUST00000197475 1341 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Psen1P49769 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Psen1P49769 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Psen1P49769 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Psen1P49769 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Psen1P49769 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Psen1P49769 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Psen1P49769 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Psen1P49769 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Psen1P49769 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Psen1P49769 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Psen1P49769 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Psen1P49769 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Psen1P49769 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Psen1P49769 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Psen1P49769 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Psen1P49769 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Psen1P49769 Vmn1r185-201ENSMUST00000171039 1144 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Psen1P49769 1700029E06Rik-201ENSMUST00000189036 757 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Psen1P49769 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Psen1P49769 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Psen1P49769 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Psen1P49769 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Psen1P49769 Vmn1r192-201ENSMUST00000072632 1067 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Psen1P49769 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Psen1P49769 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Psen1P49769 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Psen1P49769 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Psen1P49769 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Psen1P49769 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Psen1P49769 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Psen1P49769 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Psen1P49769 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Psen1P49769 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Psen1P49769 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Psen1P49769 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Psen1P49769 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Psen1P49769 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Psen1P49769 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Psen1P49769 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Psen1P49769 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Psen1P49769 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Psen1P49769 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Psen1P49769 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Psen1P49769 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Psen1P49769 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Psen1P49769 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Psen1P49769 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Psen1P49769 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Psen1P49769 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Psen1P49769 Gm12752-201ENSMUST00000121657 811 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Psen1P49769 Gm12249-201ENSMUST00000132323 719 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Psen1P49769 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Psen1P49769 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Psen1P49769 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Psen1P49769 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Psen1P49769 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Psen1P49769 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Psen1P49769 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Psen1P49769 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Psen1P49769 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Psen1P49769 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Psen1P49769 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Psen1P49769 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Psen1P49769 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Psen1P49769 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Psen1P49769 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Psen1P49769 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Psen1P49769 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms