Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtpreP49446 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtpreP49446 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PtpreP49446 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtpreP49446 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtpreP49446 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtpreP49446 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtpreP49446 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtpreP49446 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtpreP49446 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtpreP49446 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtpreP49446 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PtpreP49446 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtpreP49446 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtpreP49446 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtpreP49446 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtpreP49446 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtpreP49446 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtpreP49446 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtpreP49446 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtpreP49446 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtpreP49446 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtpreP49446 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtpreP49446 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtpreP49446 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtpreP49446 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtpreP49446 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtpreP49446 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtpreP49446 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtpreP49446 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtpreP49446 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtpreP49446 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PtpreP49446 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtpreP49446 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtpreP49446 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtpreP49446 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtpreP49446 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtpreP49446 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtpreP49446 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtpreP49446 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtpreP49446 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PtpreP49446 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PtpreP49446 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtpreP49446 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtpreP49446 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtpreP49446 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtpreP49446 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtpreP49446 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtpreP49446 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtpreP49446 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtpreP49446 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtpreP49446 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtpreP49446 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtpreP49446 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtpreP49446 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtpreP49446 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtpreP49446 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtpreP49446 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtpreP49446 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtpreP49446 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PtpreP49446 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtpreP49446 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PtpreP49446 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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PtpreP49446 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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PtpreP49446 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtpreP49446 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtpreP49446 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtpreP49446 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtpreP49446 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
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PtpreP49446 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtpreP49446 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PtpreP49446 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PtpreP49446 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PtpreP49446 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PtpreP49446 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PtpreP49446 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PtpreP49446 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PtpreP49446 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms