Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SrprbP47758 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SrprbP47758 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SrprbP47758 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SrprbP47758 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SrprbP47758 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SrprbP47758 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SrprbP47758 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SrprbP47758 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SrprbP47758 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SrprbP47758 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SrprbP47758 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SrprbP47758 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SrprbP47758 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SrprbP47758 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SrprbP47758 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SrprbP47758 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SrprbP47758 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SrprbP47758 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SrprbP47758 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SrprbP47758 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SrprbP47758 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SrprbP47758 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SrprbP47758 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SrprbP47758 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SrprbP47758 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SrprbP47758 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SrprbP47758 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SrprbP47758 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SrprbP47758 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SrprbP47758 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SrprbP47758 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SrprbP47758 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SrprbP47758 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SrprbP47758 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SrprbP47758 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SrprbP47758 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SrprbP47758 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SrprbP47758 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SrprbP47758 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SrprbP47758 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SrprbP47758 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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SrprbP47758 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SrprbP47758 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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SrprbP47758 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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SrprbP47758 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SrprbP47758 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SrprbP47758 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SrprbP47758 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SrprbP47758 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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SrprbP47758 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SrprbP47758 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SrprbP47758 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SrprbP47758 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SrprbP47758 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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SrprbP47758 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SrprbP47758 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SrprbP47758 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SrprbP47758 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SrprbP47758 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SrprbP47758 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SrprbP47758 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SrprbP47758 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SrprbP47758 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SrprbP47758 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SrprbP47758 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SrprbP47758 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SrprbP47758 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SrprbP47758 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SrprbP47758 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SrprbP47758 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SrprbP47758 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SrprbP47758 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SrprbP47758 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SrprbP47758 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SrprbP47758 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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