Protein–RNA interactions for Protein: P46096

Syt1, Synaptotagmin-1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt1P46096 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syt1P46096 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syt1P46096 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syt1P46096 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syt1P46096 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syt1P46096 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syt1P46096 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syt1P46096 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syt1P46096 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syt1P46096 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syt1P46096 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syt1P46096 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syt1P46096 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syt1P46096 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syt1P46096 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syt1P46096 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syt1P46096 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syt1P46096 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syt1P46096 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syt1P46096 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syt1P46096 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Syt1P46096 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syt1P46096 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syt1P46096 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syt1P46096 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syt1P46096 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syt1P46096 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syt1P46096 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syt1P46096 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Syt1P46096 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Syt1P46096 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Syt1P46096 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Syt1P46096 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Syt1P46096 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Syt1P46096 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Syt1P46096 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Syt1P46096 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syt1P46096 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syt1P46096 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Syt1P46096 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Syt1P46096 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syt1P46096 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Syt1P46096 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syt1P46096 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Syt1P46096 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syt1P46096 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syt1P46096 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syt1P46096 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syt1P46096 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Syt1P46096 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syt1P46096 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syt1P46096 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syt1P46096 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syt1P46096 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syt1P46096 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syt1P46096 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syt1P46096 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syt1P46096 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syt1P46096 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syt1P46096 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syt1P46096 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syt1P46096 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syt1P46096 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syt1P46096 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syt1P46096 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syt1P46096 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syt1P46096 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Syt1P46096 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syt1P46096 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syt1P46096 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syt1P46096 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syt1P46096 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syt1P46096 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Syt1P46096 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Syt1P46096 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syt1P46096 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Syt1P46096 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syt1P46096 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syt1P46096 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syt1P46096 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syt1P46096 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syt1P46096 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syt1P46096 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syt1P46096 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syt1P46096 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syt1P46096 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syt1P46096 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syt1P46096 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syt1P46096 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syt1P46096 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syt1P46096 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Syt1P46096 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syt1P46096 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syt1P46096 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syt1P46096 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syt1P46096 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syt1P46096 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syt1P46096 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syt1P46096 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syt1P46096 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms