Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Mmp9P41245 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mmp9P41245 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mmp9P41245 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mmp9P41245 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mmp9P41245 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mmp9P41245 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mmp9P41245 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mmp9P41245 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Mmp9P41245 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mmp9P41245 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mmp9P41245 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Mmp9P41245 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mmp9P41245 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mmp9P41245 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mmp9P41245 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mmp9P41245 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mmp9P41245 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
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