Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nedd1P33215 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.5 ms