Protein–RNA interactions for Protein: P32067

Ssb, Lupus La protein homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SsbP32067 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SsbP32067 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SsbP32067 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SsbP32067 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SsbP32067 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SsbP32067 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SsbP32067 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SsbP32067 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SsbP32067 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SsbP32067 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SsbP32067 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SsbP32067 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SsbP32067 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SsbP32067 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SsbP32067 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SsbP32067 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SsbP32067 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SsbP32067 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SsbP32067 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SsbP32067 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SsbP32067 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SsbP32067 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SsbP32067 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SsbP32067 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SsbP32067 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SsbP32067 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SsbP32067 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SsbP32067 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SsbP32067 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SsbP32067 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SsbP32067 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SsbP32067 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SsbP32067 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SsbP32067 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SsbP32067 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SsbP32067 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SsbP32067 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SsbP32067 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SsbP32067 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SsbP32067 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SsbP32067 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SsbP32067 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SsbP32067 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SsbP32067 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SsbP32067 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SsbP32067 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SsbP32067 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SsbP32067 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SsbP32067 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SsbP32067 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SsbP32067 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SsbP32067 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SsbP32067 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SsbP32067 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SsbP32067 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SsbP32067 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SsbP32067 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SsbP32067 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SsbP32067 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SsbP32067 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SsbP32067 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SsbP32067 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SsbP32067 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SsbP32067 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SsbP32067 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SsbP32067 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SsbP32067 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SsbP32067 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SsbP32067 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SsbP32067 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SsbP32067 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SsbP32067 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SsbP32067 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SsbP32067 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SsbP32067 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SsbP32067 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SsbP32067 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SsbP32067 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SsbP32067 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SsbP32067 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SsbP32067 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SsbP32067 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SsbP32067 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SsbP32067 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SsbP32067 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SsbP32067 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SsbP32067 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SsbP32067 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SsbP32067 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SsbP32067 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SsbP32067 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SsbP32067 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SsbP32067 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SsbP32067 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SsbP32067 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SsbP32067 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SsbP32067 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SsbP32067 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SsbP32067 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SsbP32067 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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