Protein–RNA interactions for Protein: P29533

Vcam1, Vascular cell adhesion protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vcam1P29533 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vcam1P29533 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vcam1P29533 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Vcam1P29533 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vcam1P29533 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vcam1P29533 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vcam1P29533 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vcam1P29533 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vcam1P29533 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vcam1P29533 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vcam1P29533 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vcam1P29533 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vcam1P29533 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vcam1P29533 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vcam1P29533 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vcam1P29533 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vcam1P29533 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vcam1P29533 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vcam1P29533 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vcam1P29533 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vcam1P29533 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vcam1P29533 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vcam1P29533 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vcam1P29533 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vcam1P29533 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vcam1P29533 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vcam1P29533 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vcam1P29533 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vcam1P29533 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vcam1P29533 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vcam1P29533 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vcam1P29533 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vcam1P29533 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vcam1P29533 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vcam1P29533 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vcam1P29533 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vcam1P29533 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vcam1P29533 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vcam1P29533 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vcam1P29533 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vcam1P29533 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vcam1P29533 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vcam1P29533 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vcam1P29533 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vcam1P29533 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vcam1P29533 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vcam1P29533 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vcam1P29533 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vcam1P29533 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vcam1P29533 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vcam1P29533 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vcam1P29533 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vcam1P29533 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vcam1P29533 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vcam1P29533 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vcam1P29533 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vcam1P29533 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vcam1P29533 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vcam1P29533 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Vcam1P29533 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vcam1P29533 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vcam1P29533 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vcam1P29533 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vcam1P29533 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vcam1P29533 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vcam1P29533 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Vcam1P29533 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vcam1P29533 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Vcam1P29533 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vcam1P29533 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vcam1P29533 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vcam1P29533 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vcam1P29533 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vcam1P29533 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vcam1P29533 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vcam1P29533 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vcam1P29533 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vcam1P29533 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Vcam1P29533 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vcam1P29533 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vcam1P29533 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vcam1P29533 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vcam1P29533 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vcam1P29533 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vcam1P29533 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vcam1P29533 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Vcam1P29533 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vcam1P29533 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vcam1P29533 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vcam1P29533 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Vcam1P29533 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vcam1P29533 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vcam1P29533 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vcam1P29533 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Vcam1P29533 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vcam1P29533 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vcam1P29533 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vcam1P29533 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vcam1P29533 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vcam1P29533 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms