Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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RxrgP28705 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RxrgP28705 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RxrgP28705 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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