Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RxraP28700 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RxraP28700 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RxraP28700 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RxraP28700 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RxraP28700 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RxraP28700 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RxraP28700 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RxraP28700 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RxraP28700 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RxraP28700 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RxraP28700 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RxraP28700 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RxraP28700 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RxraP28700 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RxraP28700 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RxraP28700 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RxraP28700 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
RxraP28700 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RxraP28700 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RxraP28700 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RxraP28700 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
RxraP28700 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
RxraP28700 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
RxraP28700 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RxraP28700 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RxraP28700 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
RxraP28700 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RxraP28700 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RxraP28700 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RxraP28700 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RxraP28700 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RxraP28700 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RxraP28700 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RxraP28700 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RxraP28700 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RxraP28700 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RxraP28700 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RxraP28700 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RxraP28700 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RxraP28700 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RxraP28700 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RxraP28700 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RxraP28700 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RxraP28700 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RxraP28700 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RxraP28700 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RxraP28700 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RxraP28700 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RxraP28700 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
RxraP28700 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RxraP28700 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RxraP28700 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RxraP28700 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RxraP28700 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RxraP28700 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RxraP28700 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RxraP28700 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
RxraP28700 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RxraP28700 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
RxraP28700 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RxraP28700 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RxraP28700 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RxraP28700 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RxraP28700 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RxraP28700 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RxraP28700 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RxraP28700 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RxraP28700 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RxraP28700 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
RxraP28700 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
RxraP28700 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RxraP28700 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RxraP28700 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RxraP28700 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RxraP28700 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RxraP28700 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RxraP28700 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RxraP28700 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RxraP28700 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
RxraP28700 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
RxraP28700 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
RxraP28700 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RxraP28700 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RxraP28700 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
RxraP28700 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
RxraP28700 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
RxraP28700 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RxraP28700 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RxraP28700 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RxraP28700 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RxraP28700 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RxraP28700 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RxraP28700 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RxraP28700 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RxraP28700 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RxraP28700 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
RxraP28700 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RxraP28700 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RxraP28700 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
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