Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjb1P28230 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms