Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PparaP23204 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PparaP23204 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PparaP23204 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PparaP23204 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PparaP23204 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PparaP23204 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PparaP23204 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PparaP23204 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PparaP23204 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PparaP23204 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PparaP23204 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PparaP23204 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PparaP23204 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PparaP23204 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PparaP23204 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PparaP23204 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PparaP23204 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PparaP23204 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PparaP23204 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PparaP23204 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PparaP23204 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PparaP23204 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PparaP23204 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PparaP23204 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PparaP23204 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PparaP23204 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PparaP23204 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PparaP23204 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PparaP23204 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PparaP23204 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PparaP23204 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PparaP23204 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PparaP23204 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PparaP23204 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PparaP23204 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PparaP23204 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PparaP23204 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PparaP23204 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PparaP23204 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PparaP23204 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PparaP23204 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PparaP23204 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PparaP23204 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PparaP23204 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PparaP23204 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PparaP23204 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PparaP23204 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PparaP23204 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PparaP23204 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PparaP23204 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PparaP23204 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PparaP23204 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PparaP23204 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PparaP23204 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PparaP23204 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PparaP23204 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PparaP23204 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PparaP23204 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PparaP23204 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PparaP23204 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PparaP23204 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PparaP23204 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PparaP23204 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PparaP23204 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PparaP23204 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PparaP23204 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PparaP23204 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PparaP23204 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PparaP23204 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PparaP23204 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PparaP23204 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PparaP23204 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PparaP23204 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PparaP23204 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PparaP23204 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PparaP23204 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PparaP23204 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PparaP23204 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PparaP23204 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PparaP23204 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PparaP23204 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PparaP23204 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PparaP23204 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PparaP23204 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PparaP23204 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PparaP23204 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PparaP23204 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PparaP23204 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PparaP23204 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PparaP23204 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PparaP23204 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PparaP23204 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PparaP23204 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PparaP23204 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PparaP23204 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PparaP23204 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PparaP23204 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PparaP23204 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PparaP23204 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms