Protein–RNA interactions for Protein: P18526

Ig heavy chain V region 345, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18526 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18526 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
P18526 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
P18526 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
P18526 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
P18526 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18526 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
P18526 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
P18526 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18526 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18526 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
P18526 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18526 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18526 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18526 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18526 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18526 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18526 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18526 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18526 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18526 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18526 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18526 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18526 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18526 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18526 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18526 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18526 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18526 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18526 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18526 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18526 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18526 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18526 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P18526 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18526 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18526 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18526 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18526 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18526 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18526 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18526 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18526 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18526 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18526 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18526 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18526 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18526 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18526 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18526 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18526 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18526 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18526 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18526 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18526 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18526 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18526 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18526 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18526 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P18526 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18526 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18526 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18526 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P18526 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P18526 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18526 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18526 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18526 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18526 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18526 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18526 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18526 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18526 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
P18526 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
P18526 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
P18526 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
P18526 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
P18526 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
P18526 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
P18526 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
P18526 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
P18526 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18526 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18526 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18526 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18526 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18526 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18526 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18526 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18526 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18526 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18526 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P18526 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18526 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18526 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18526 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18526 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18526 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18526 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18526 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms