Protein–RNA interactions for Protein: P18525

Ig heavy chain V region 5-84, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18525 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18525 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18525 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18525 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18525 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18525 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18525 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18525 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18525 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18525 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18525 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P18525 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P18525 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P18525 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
P18525 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
P18525 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
P18525 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P18525 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P18525 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P18525 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P18525 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
P18525 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
P18525 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
P18525 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
P18525 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
P18525 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
P18525 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
P18525 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
P18525 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
P18525 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
P18525 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
P18525 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
P18525 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
P18525 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
P18525 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
P18525 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P18525 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P18525 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P18525 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P18525 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P18525 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P18525 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P18525 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
P18525 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P18525 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
P18525 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P18525 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
P18525 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P18525 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P18525 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P18525 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
P18525 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P18525 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P18525 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P18525 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
P18525 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
P18525 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
P18525 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P18525 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P18525 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
P18525 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P18525 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P18525 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
P18525 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
P18525 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
P18525 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
P18525 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P18525 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P18525 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P18525 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P18525 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P18525 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
P18525 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P18525 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
P18525 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P18525 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
P18525 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
P18525 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
P18525 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
P18525 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
P18525 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
P18525 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P18525 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
P18525 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
P18525 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P18525 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
P18525 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
P18525 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
P18525 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
P18525 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P18525 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
P18525 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P18525 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P18525 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P18525 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
P18525 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P18525 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
P18525 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P18525 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P18525 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms