Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 CT009764.1-201ENSMUST00000222260 483 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxb1P17919 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Hoxb1P17919 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
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Hoxb1P17919 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Hoxb1P17919 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Hoxb1P17919 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Hoxb1P17919 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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