Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
PcnaP17918 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PcnaP17918 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
PcnaP17918 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
PcnaP17918 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PcnaP17918 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PcnaP17918 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PcnaP17918 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PcnaP17918 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PcnaP17918 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
PcnaP17918 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms