Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RhoP15409 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
RhoP15409 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RhoP15409 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RhoP15409 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
RhoP15409 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RhoP15409 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RhoP15409 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RhoP15409 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
RhoP15409 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
RhoP15409 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
RhoP15409 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RhoP15409 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RhoP15409 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RhoP15409 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RhoP15409 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RhoP15409 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RhoP15409 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RhoP15409 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RhoP15409 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RhoP15409 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RhoP15409 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RhoP15409 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RhoP15409 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RhoP15409 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RhoP15409 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RhoP15409 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RhoP15409 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RhoP15409 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RhoP15409 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RhoP15409 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
RhoP15409 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RhoP15409 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RhoP15409 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RhoP15409 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RhoP15409 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RhoP15409 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
RhoP15409 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RhoP15409 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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RhoP15409 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
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RhoP15409 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RhoP15409 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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RhoP15409 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RhoP15409 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RhoP15409 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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RhoP15409 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RhoP15409 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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RhoP15409 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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RhoP15409 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RhoP15409 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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RhoP15409 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RhoP15409 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RhoP15409 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RhoP15409 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
RhoP15409 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RhoP15409 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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RhoP15409 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RhoP15409 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RhoP15409 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RhoP15409 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
RhoP15409 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RhoP15409 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
RhoP15409 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RhoP15409 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RhoP15409 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RhoP15409 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RhoP15409 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RhoP15409 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RhoP15409 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RhoP15409 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RhoP15409 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RhoP15409 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RhoP15409 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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