Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
DmdP11531 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DmdP11531 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DmdP11531 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DmdP11531 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DmdP11531 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DmdP11531 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DmdP11531 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DmdP11531 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DmdP11531 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DmdP11531 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DmdP11531 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DmdP11531 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DmdP11531 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DmdP11531 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DmdP11531 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DmdP11531 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DmdP11531 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DmdP11531 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DmdP11531 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DmdP11531 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DmdP11531 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DmdP11531 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DmdP11531 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DmdP11531 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DmdP11531 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DmdP11531 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DmdP11531 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DmdP11531 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DmdP11531 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DmdP11531 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DmdP11531 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
DmdP11531 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DmdP11531 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DmdP11531 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DmdP11531 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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DmdP11531 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DmdP11531 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DmdP11531 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DmdP11531 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
DmdP11531 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
DmdP11531 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DmdP11531 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DmdP11531 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DmdP11531 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DmdP11531 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DmdP11531 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DmdP11531 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DmdP11531 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DmdP11531 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
DmdP11531 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DmdP11531 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DmdP11531 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DmdP11531 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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DmdP11531 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DmdP11531 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DmdP11531 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
DmdP11531 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DmdP11531 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
DmdP11531 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
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DmdP11531 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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DmdP11531 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DmdP11531 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DmdP11531 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DmdP11531 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DmdP11531 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DmdP11531 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
DmdP11531 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DmdP11531 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DmdP11531 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DmdP11531 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DmdP11531 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
DmdP11531 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DmdP11531 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DmdP11531 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
DmdP11531 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DmdP11531 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DmdP11531 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DmdP11531 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
DmdP11531 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
DmdP11531 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DmdP11531 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
DmdP11531 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
DmdP11531 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DmdP11531 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
DmdP11531 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms