Protein–RNA interactions for Protein: P10400

Pol, Retrovirus-related Pol polyprotein (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP10400 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PolP10400 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PolP10400 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PolP10400 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PolP10400 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PolP10400 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PolP10400 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PolP10400 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PolP10400 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PolP10400 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PolP10400 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PolP10400 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PolP10400 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PolP10400 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PolP10400 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PolP10400 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PolP10400 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PolP10400 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PolP10400 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PolP10400 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PolP10400 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PolP10400 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PolP10400 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PolP10400 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PolP10400 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PolP10400 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PolP10400 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PolP10400 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PolP10400 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PolP10400 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PolP10400 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PolP10400 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PolP10400 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PolP10400 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PolP10400 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PolP10400 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PolP10400 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PolP10400 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PolP10400 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PolP10400 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
PolP10400 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PolP10400 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PolP10400 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
PolP10400 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PolP10400 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PolP10400 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PolP10400 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PolP10400 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PolP10400 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PolP10400 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PolP10400 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PolP10400 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
PolP10400 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PolP10400 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PolP10400 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PolP10400 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PolP10400 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PolP10400 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PolP10400 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
PolP10400 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PolP10400 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PolP10400 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PolP10400 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PolP10400 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PolP10400 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PolP10400 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
PolP10400 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
PolP10400 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
PolP10400 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
PolP10400 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
PolP10400 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
PolP10400 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
PolP10400 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
PolP10400 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PolP10400 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PolP10400 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
PolP10400 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
PolP10400 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PolP10400 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
PolP10400 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
PolP10400 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
PolP10400 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
PolP10400 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PolP10400 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
PolP10400 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
PolP10400 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PolP10400 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
PolP10400 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
PolP10400 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
PolP10400 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
PolP10400 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PolP10400 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
PolP10400 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PolP10400 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PolP10400 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PolP10400 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
PolP10400 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PolP10400 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PolP10400 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PolP10400 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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