Protein–RNA interactions for Protein: P0CG49

Ubb, Polyubiquitin-B, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbbP0CG49 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
UbbP0CG49 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
UbbP0CG49 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
UbbP0CG49 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
UbbP0CG49 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
UbbP0CG49 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
UbbP0CG49 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
UbbP0CG49 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
UbbP0CG49 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
UbbP0CG49 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
UbbP0CG49 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
UbbP0CG49 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
UbbP0CG49 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
UbbP0CG49 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
UbbP0CG49 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
UbbP0CG49 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
UbbP0CG49 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
UbbP0CG49 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
UbbP0CG49 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
UbbP0CG49 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
UbbP0CG49 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
UbbP0CG49 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
UbbP0CG49 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
UbbP0CG49 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
UbbP0CG49 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
UbbP0CG49 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
UbbP0CG49 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
UbbP0CG49 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
UbbP0CG49 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
UbbP0CG49 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
UbbP0CG49 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
UbbP0CG49 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
UbbP0CG49 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
UbbP0CG49 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC12□□□□□ -0.49
UbbP0CG49 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC12□□□□□ -0.49
UbbP0CG49 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC12□□□□□ -0.49
UbbP0CG49 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
UbbP0CG49 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
UbbP0CG49 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
UbbP0CG49 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
UbbP0CG49 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
UbbP0CG49 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
UbbP0CG49 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
UbbP0CG49 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
UbbP0CG49 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
UbbP0CG49 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
UbbP0CG49 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
UbbP0CG49 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
UbbP0CG49 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
UbbP0CG49 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
UbbP0CG49 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
UbbP0CG49 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
UbbP0CG49 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
UbbP0CG49 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
UbbP0CG49 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
UbbP0CG49 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
UbbP0CG49 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
UbbP0CG49 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
UbbP0CG49 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
UbbP0CG49 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
UbbP0CG49 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
UbbP0CG49 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
UbbP0CG49 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
UbbP0CG49 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
UbbP0CG49 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
UbbP0CG49 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
UbbP0CG49 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
UbbP0CG49 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
UbbP0CG49 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
UbbP0CG49 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
UbbP0CG49 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
UbbP0CG49 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
UbbP0CG49 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
UbbP0CG49 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
UbbP0CG49 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
UbbP0CG49 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
UbbP0CG49 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
UbbP0CG49 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
UbbP0CG49 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
UbbP0CG49 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
UbbP0CG49 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
UbbP0CG49 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
UbbP0CG49 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
UbbP0CG49 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
UbbP0CG49 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
UbbP0CG49 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
UbbP0CG49 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
UbbP0CG49 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
UbbP0CG49 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
UbbP0CG49 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
UbbP0CG49 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
UbbP0CG49 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
UbbP0CG49 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
UbbP0CG49 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
UbbP0CG49 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
UbbP0CG49 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
UbbP0CG49 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
UbbP0CG49 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
UbbP0CG49 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
UbbP0CG49 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms