Protein–RNA interactions for Protein: P06798

Hoxa4, Homeobox protein Hox-A4, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa4P06798 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxa4P06798 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxa4P06798 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxa4P06798 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxa4P06798 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxa4P06798 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxa4P06798 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxa4P06798 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxa4P06798 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxa4P06798 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxa4P06798 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxa4P06798 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxa4P06798 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxa4P06798 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxa4P06798 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxa4P06798 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxa4P06798 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxa4P06798 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxa4P06798 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxa4P06798 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxa4P06798 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxa4P06798 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxa4P06798 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxa4P06798 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxa4P06798 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxa4P06798 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxa4P06798 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxa4P06798 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxa4P06798 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxa4P06798 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxa4P06798 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxa4P06798 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxa4P06798 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxa4P06798 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxa4P06798 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxa4P06798 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxa4P06798 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxa4P06798 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxa4P06798 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxa4P06798 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxa4P06798 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxa4P06798 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxa4P06798 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxa4P06798 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxa4P06798 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxa4P06798 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxa4P06798 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxa4P06798 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxa4P06798 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxa4P06798 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxa4P06798 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxa4P06798 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxa4P06798 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxa4P06798 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxa4P06798 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxa4P06798 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxa4P06798 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxa4P06798 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxa4P06798 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxa4P06798 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxa4P06798 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxa4P06798 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxa4P06798 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxa4P06798 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxa4P06798 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxa4P06798 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxa4P06798 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxa4P06798 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxa4P06798 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxa4P06798 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxa4P06798 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxa4P06798 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxa4P06798 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxa4P06798 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxa4P06798 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxa4P06798 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxa4P06798 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxa4P06798 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxa4P06798 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxa4P06798 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxa4P06798 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxa4P06798 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxa4P06798 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxa4P06798 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxa4P06798 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxa4P06798 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxa4P06798 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxa4P06798 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxa4P06798 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxa4P06798 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxa4P06798 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxa4P06798 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxa4P06798 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxa4P06798 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxa4P06798 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxa4P06798 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxa4P06798 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxa4P06798 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxa4P06798 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxa4P06798 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms