Protein–RNA interactions for Protein: P00848

Mtatp6, ATP synthase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtatp6P00848 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms