Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

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Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Lnx1O70263 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Lnx1O70263 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Lnx1O70263 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Lnx1O70263 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Lnx1O70263 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Lnx1O70263 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lnx1O70263 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Lnx1O70263 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Lnx1O70263 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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Lnx1O70263 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lnx1O70263 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lnx1O70263 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lnx1O70263 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lnx1O70263 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lnx1O70263 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Lnx1O70263 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Lnx1O70263 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lnx1O70263 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lnx1O70263 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Lnx1O70263 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lnx1O70263 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Lnx1O70263 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lnx1O70263 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lnx1O70263 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lnx1O70263 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lnx1O70263 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lnx1O70263 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lnx1O70263 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lnx1O70263 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms