Protein–RNA interactions for Protein: O70126

Aurkb, Aurora kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkbO70126 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AurkbO70126 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AurkbO70126 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AurkbO70126 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AurkbO70126 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AurkbO70126 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AurkbO70126 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AurkbO70126 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AurkbO70126 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AurkbO70126 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AurkbO70126 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AurkbO70126 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AurkbO70126 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AurkbO70126 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AurkbO70126 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AurkbO70126 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AurkbO70126 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AurkbO70126 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AurkbO70126 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AurkbO70126 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AurkbO70126 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AurkbO70126 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AurkbO70126 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AurkbO70126 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AurkbO70126 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AurkbO70126 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AurkbO70126 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AurkbO70126 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
AurkbO70126 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
AurkbO70126 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AurkbO70126 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AurkbO70126 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AurkbO70126 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AurkbO70126 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AurkbO70126 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AurkbO70126 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AurkbO70126 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AurkbO70126 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
AurkbO70126 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AurkbO70126 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
AurkbO70126 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AurkbO70126 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AurkbO70126 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AurkbO70126 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AurkbO70126 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AurkbO70126 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AurkbO70126 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AurkbO70126 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AurkbO70126 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
AurkbO70126 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
AurkbO70126 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
AurkbO70126 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
AurkbO70126 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
AurkbO70126 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
AurkbO70126 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
AurkbO70126 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AurkbO70126 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AurkbO70126 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AurkbO70126 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AurkbO70126 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AurkbO70126 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
AurkbO70126 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AurkbO70126 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AurkbO70126 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.08■□□□□ 0
AurkbO70126 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AurkbO70126 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AurkbO70126 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AurkbO70126 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.08■□□□□ 0
AurkbO70126 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AurkbO70126 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AurkbO70126 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AurkbO70126 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.08■□□□□ 0
AurkbO70126 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
AurkbO70126 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AurkbO70126 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AurkbO70126 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AurkbO70126 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AurkbO70126 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AurkbO70126 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AurkbO70126 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AurkbO70126 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
AurkbO70126 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AurkbO70126 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AurkbO70126 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AurkbO70126 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.07■□□□□ 0
AurkbO70126 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AurkbO70126 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AurkbO70126 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
AurkbO70126 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AurkbO70126 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
AurkbO70126 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
AurkbO70126 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AurkbO70126 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AurkbO70126 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AurkbO70126 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AurkbO70126 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
AurkbO70126 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AurkbO70126 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AurkbO70126 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AurkbO70126 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms