Protein–RNA interactions for Protein: O55203

Ldb2, LIM domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb2O55203 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ldb2O55203 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ldb2O55203 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ldb2O55203 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ldb2O55203 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ldb2O55203 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ldb2O55203 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ldb2O55203 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ldb2O55203 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ldb2O55203 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ldb2O55203 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ldb2O55203 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ldb2O55203 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ldb2O55203 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ldb2O55203 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ldb2O55203 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ldb2O55203 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ldb2O55203 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ldb2O55203 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ldb2O55203 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ldb2O55203 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ldb2O55203 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ldb2O55203 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ldb2O55203 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ldb2O55203 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ldb2O55203 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ldb2O55203 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ldb2O55203 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ldb2O55203 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ldb2O55203 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ldb2O55203 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ldb2O55203 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ldb2O55203 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ldb2O55203 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ldb2O55203 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ldb2O55203 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ldb2O55203 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ldb2O55203 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ldb2O55203 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ldb2O55203 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ldb2O55203 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ldb2O55203 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ldb2O55203 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ldb2O55203 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ldb2O55203 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ldb2O55203 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ldb2O55203 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ldb2O55203 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ldb2O55203 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ldb2O55203 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ldb2O55203 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ldb2O55203 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ldb2O55203 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ldb2O55203 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ldb2O55203 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ldb2O55203 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ldb2O55203 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ldb2O55203 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ldb2O55203 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ldb2O55203 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Ldb2O55203 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ldb2O55203 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ldb2O55203 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ldb2O55203 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ldb2O55203 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ldb2O55203 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ldb2O55203 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ldb2O55203 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ldb2O55203 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ldb2O55203 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ldb2O55203 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ldb2O55203 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ldb2O55203 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ldb2O55203 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ldb2O55203 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ldb2O55203 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ldb2O55203 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ldb2O55203 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ldb2O55203 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ldb2O55203 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ldb2O55203 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ldb2O55203 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ldb2O55203 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ldb2O55203 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ldb2O55203 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ldb2O55203 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ldb2O55203 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ldb2O55203 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ldb2O55203 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ldb2O55203 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ldb2O55203 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ldb2O55203 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ldb2O55203 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ldb2O55203 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ldb2O55203 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ldb2O55203 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ldb2O55203 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ldb2O55203 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ldb2O55203 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ldb2O55203 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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