Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Copb2O55029 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Copb2O55029 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Copb2O55029 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Copb2O55029 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Copb2O55029 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Copb2O55029 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Copb2O55029 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Copb2O55029 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Copb2O55029 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Copb2O55029 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Copb2O55029 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Copb2O55029 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Copb2O55029 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Copb2O55029 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Copb2O55029 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Copb2O55029 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Copb2O55029 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Copb2O55029 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Copb2O55029 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Copb2O55029 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Copb2O55029 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Copb2O55029 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Copb2O55029 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Copb2O55029 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Copb2O55029 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Copb2O55029 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Copb2O55029 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Copb2O55029 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Copb2O55029 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Copb2O55029 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Copb2O55029 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Copb2O55029 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Copb2O55029 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Copb2O55029 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Copb2O55029 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Copb2O55029 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Copb2O55029 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Copb2O55029 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Copb2O55029 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Copb2O55029 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Copb2O55029 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Copb2O55029 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Copb2O55029 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Copb2O55029 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Copb2O55029 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Copb2O55029 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Copb2O55029 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Copb2O55029 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Copb2O55029 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Copb2O55029 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Copb2O55029 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Copb2O55029 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Copb2O55029 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Copb2O55029 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Copb2O55029 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Copb2O55029 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Copb2O55029 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Copb2O55029 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Copb2O55029 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Copb2O55029 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Copb2O55029 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Copb2O55029 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Copb2O55029 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Copb2O55029 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Copb2O55029 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Copb2O55029 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms