Protein–RNA interactions for Protein: O54724

Cavin1, Caveolae-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cavin1O54724 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms