Protein–RNA interactions for Protein: O35943

Fxn, Frataxin, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FxnO35943 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FxnO35943 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FxnO35943 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FxnO35943 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FxnO35943 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
FxnO35943 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FxnO35943 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
FxnO35943 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FxnO35943 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FxnO35943 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FxnO35943 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
FxnO35943 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FxnO35943 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FxnO35943 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FxnO35943 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FxnO35943 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FxnO35943 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FxnO35943 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FxnO35943 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FxnO35943 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FxnO35943 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FxnO35943 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
FxnO35943 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FxnO35943 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FxnO35943 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FxnO35943 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FxnO35943 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FxnO35943 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FxnO35943 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FxnO35943 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FxnO35943 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FxnO35943 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FxnO35943 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FxnO35943 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FxnO35943 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FxnO35943 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FxnO35943 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FxnO35943 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FxnO35943 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FxnO35943 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FxnO35943 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FxnO35943 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FxnO35943 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FxnO35943 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FxnO35943 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FxnO35943 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FxnO35943 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FxnO35943 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FxnO35943 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FxnO35943 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FxnO35943 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FxnO35943 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FxnO35943 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FxnO35943 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FxnO35943 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FxnO35943 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FxnO35943 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FxnO35943 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FxnO35943 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FxnO35943 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
FxnO35943 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FxnO35943 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FxnO35943 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
FxnO35943 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FxnO35943 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FxnO35943 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FxnO35943 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
FxnO35943 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FxnO35943 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FxnO35943 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FxnO35943 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FxnO35943 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
FxnO35943 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FxnO35943 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FxnO35943 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FxnO35943 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FxnO35943 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FxnO35943 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FxnO35943 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FxnO35943 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
FxnO35943 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FxnO35943 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FxnO35943 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FxnO35943 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FxnO35943 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FxnO35943 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FxnO35943 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FxnO35943 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FxnO35943 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FxnO35943 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FxnO35943 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FxnO35943 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FxnO35943 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FxnO35943 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FxnO35943 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FxnO35943 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FxnO35943 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FxnO35943 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FxnO35943 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FxnO35943 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms