Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Prrt1O35449 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Prrt1O35449 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
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Prrt1O35449 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Prrt1O35449 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Prrt1O35449 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Prrt1O35449 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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