Protein–RNA interactions for Protein: O35392

Foxd2, Forkhead box protein D2, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd2O35392 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Foxd2O35392 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Foxd2O35392 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Foxd2O35392 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Foxd2O35392 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Foxd2O35392 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Foxd2O35392 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Foxd2O35392 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Foxd2O35392 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Foxd2O35392 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Foxd2O35392 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Foxd2O35392 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Foxd2O35392 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Foxd2O35392 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Foxd2O35392 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Foxd2O35392 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Foxd2O35392 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Foxd2O35392 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Foxd2O35392 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Foxd2O35392 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Foxd2O35392 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Foxd2O35392 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Foxd2O35392 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Foxd2O35392 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Foxd2O35392 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Foxd2O35392 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Foxd2O35392 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Foxd2O35392 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Foxd2O35392 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Foxd2O35392 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Foxd2O35392 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Foxd2O35392 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Foxd2O35392 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Foxd2O35392 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Foxd2O35392 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Foxd2O35392 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Foxd2O35392 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Foxd2O35392 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Foxd2O35392 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Foxd2O35392 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Foxd2O35392 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Foxd2O35392 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Foxd2O35392 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Foxd2O35392 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Foxd2O35392 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Foxd2O35392 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Foxd2O35392 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Foxd2O35392 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Foxd2O35392 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Foxd2O35392 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Foxd2O35392 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Foxd2O35392 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Foxd2O35392 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Foxd2O35392 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Foxd2O35392 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Foxd2O35392 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Foxd2O35392 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Foxd2O35392 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Foxd2O35392 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Foxd2O35392 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Foxd2O35392 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Foxd2O35392 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Foxd2O35392 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Foxd2O35392 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Foxd2O35392 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Foxd2O35392 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Foxd2O35392 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Foxd2O35392 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Foxd2O35392 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Foxd2O35392 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Foxd2O35392 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Foxd2O35392 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Foxd2O35392 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Foxd2O35392 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Foxd2O35392 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Foxd2O35392 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Foxd2O35392 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Foxd2O35392 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Foxd2O35392 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Foxd2O35392 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Foxd2O35392 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Foxd2O35392 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Foxd2O35392 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Foxd2O35392 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Foxd2O35392 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Foxd2O35392 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Foxd2O35392 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Foxd2O35392 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Foxd2O35392 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Foxd2O35392 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Foxd2O35392 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Foxd2O35392 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Foxd2O35392 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Foxd2O35392 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Foxd2O35392 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Foxd2O35392 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Foxd2O35392 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Foxd2O35392 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Foxd2O35392 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Foxd2O35392 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms