Protein–RNA interactions for Protein: O35239

Ptpn9, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 9, mousemouse

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Length 593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ptpn9O35239 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ptpn9O35239 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ptpn9O35239 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ptpn9O35239 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ptpn9O35239 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ptpn9O35239 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ptpn9O35239 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ptpn9O35239 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ptpn9O35239 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ptpn9O35239 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Ptpn9O35239 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ptpn9O35239 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
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Ptpn9O35239 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ptpn9O35239 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ptpn9O35239 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
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Ptpn9O35239 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ptpn9O35239 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ptpn9O35239 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ptpn9O35239 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ptpn9O35239 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
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Ptpn9O35239 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Ptpn9O35239 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
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Ptpn9O35239 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ptpn9O35239 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
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Ptpn9O35239 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
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Ptpn9O35239 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ptpn9O35239 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ptpn9O35239 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ptpn9O35239 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ptpn9O35239 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
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Ptpn9O35239 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
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Ptpn9O35239 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
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Ptpn9O35239 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ptpn9O35239 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ptpn9O35239 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
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Ptpn9O35239 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ptpn9O35239 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ptpn9O35239 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ptpn9O35239 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ptpn9O35239 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ptpn9O35239 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ptpn9O35239 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ptpn9O35239 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ptpn9O35239 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ptpn9O35239 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Ptpn9O35239 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ptpn9O35239 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ptpn9O35239 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ptpn9O35239 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ptpn9O35239 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Ptpn9O35239 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ptpn9O35239 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ptpn9O35239 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ptpn9O35239 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ptpn9O35239 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ptpn9O35239 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ptpn9O35239 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ptpn9O35239 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
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Ptpn9O35239 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ptpn9O35239 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Ptpn9O35239 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ptpn9O35239 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
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