Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Eftud2O08810 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Eftud2O08810 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms