Protein–RNA interactions for Protein: O08795

Prkcsh, Glucosidase 2 subunit beta, mousemouse

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Length 521 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcshO08795 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Mef2a-204ENSMUST00000107476 4759 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Gm17980-201ENSMUST00000217977 2349 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Gm37333-201ENSMUST00000192904 2251 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Dqx1-201ENSMUST00000077502 3257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 4632411P08Rik-201ENSMUST00000181005 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Mir124a-1hg-201ENSMUST00000180610 4103 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Fsd2-201ENSMUST00000042318 3985 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Raver1-201ENSMUST00000115487 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Gm5403-201ENSMUST00000117105 2795 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 1700030K09Rik-202ENSMUST00000121902 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PrkcshO08795 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PrkcshO08795 Trp63-207ENSMUST00000115308 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PrkcshO08795 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PrkcshO08795 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms