Protein–RNA interactions for Protein: J3QP38

Gm21900, Predicted gene, 21900, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21900J3QP38 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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Gm21900J3QP38 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21900J3QP38 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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