Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
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Smim18J3QNP2 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Smim18J3QNP2 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Smim18J3QNP2 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Smim18J3QNP2 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Smim18J3QNP2 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Smim18J3QNP2 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Smim18J3QNP2 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Smim18J3QNP2 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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Smim18J3QNP2 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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Smim18J3QNP2 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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