Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc180J3QNE4 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc180J3QNE4 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc180J3QNE4 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc180J3QNE4 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc180J3QNE4 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc180J3QNE4 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc180J3QNE4 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc180J3QNE4 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc180J3QNE4 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc180J3QNE4 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc180J3QNE4 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc180J3QNE4 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc180J3QNE4 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc180J3QNE4 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc180J3QNE4 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc180J3QNE4 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc180J3QNE4 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc180J3QNE4 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc180J3QNE4 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc180J3QNE4 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc180J3QNE4 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc180J3QNE4 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc180J3QNE4 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc180J3QNE4 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc180J3QNE4 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc180J3QNE4 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc180J3QNE4 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc180J3QNE4 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc180J3QNE4 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc180J3QNE4 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc180J3QNE4 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc180J3QNE4 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc180J3QNE4 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc180J3QNE4 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc180J3QNE4 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc180J3QNE4 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc180J3QNE4 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc180J3QNE4 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc180J3QNE4 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc180J3QNE4 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc180J3QNE4 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc180J3QNE4 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc180J3QNE4 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc180J3QNE4 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc180J3QNE4 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc180J3QNE4 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc180J3QNE4 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc180J3QNE4 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc180J3QNE4 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc180J3QNE4 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc180J3QNE4 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc180J3QNE4 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc180J3QNE4 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc180J3QNE4 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc180J3QNE4 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc180J3QNE4 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc180J3QNE4 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc180J3QNE4 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc180J3QNE4 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc180J3QNE4 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc180J3QNE4 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc180J3QNE4 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc180J3QNE4 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc180J3QNE4 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc180J3QNE4 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc180J3QNE4 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc180J3QNE4 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc180J3QNE4 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc180J3QNE4 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc180J3QNE4 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc180J3QNE4 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc180J3QNE4 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc180J3QNE4 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc180J3QNE4 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc180J3QNE4 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc180J3QNE4 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc180J3QNE4 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc180J3QNE4 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc180J3QNE4 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc180J3QNE4 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc180J3QNE4 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc180J3QNE4 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc180J3QNE4 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc180J3QNE4 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc180J3QNE4 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc180J3QNE4 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc180J3QNE4 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc180J3QNE4 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc180J3QNE4 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc180J3QNE4 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc180J3QNE4 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc180J3QNE4 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc180J3QNE4 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc180J3QNE4 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc180J3QNE4 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc180J3QNE4 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc180J3QNE4 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc180J3QNE4 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc180J3QNE4 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms