Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Gm20830J3KML6 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Gm20830J3KML6 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
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Gm20830J3KML6 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
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Gm20830J3KML6 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20830J3KML6 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
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