Protein–RNA interactions for Protein: F6VRJ8

Gm8247, Predicted gene 8247 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8247F6VRJ8 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm8247F6VRJ8 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms