Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms