Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9P8

Rdh16f1, RDH16 family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16f1E9Q9P8 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rdh16f1E9Q9P8 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rdh16f1E9Q9P8 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Rdh16f1E9Q9P8 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rdh16f1E9Q9P8 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rdh16f1E9Q9P8 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rdh16f1E9Q9P8 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Rdh16f1E9Q9P8 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms