Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
ApobE9Q414 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.1
ApobE9Q414 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
ApobE9Q414 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.2□□□□□ -1.1
ApobE9Q414 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
ApobE9Q414 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
ApobE9Q414 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.1
ApobE9Q414 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
ApobE9Q414 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.1
ApobE9Q414 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
ApobE9Q414 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC8.2□□□□□ -1.1
ApobE9Q414 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
ApobE9Q414 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
ApobE9Q414 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
ApobE9Q414 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
ApobE9Q414 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
ApobE9Q414 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.1
ApobE9Q414 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
ApobE9Q414 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
ApobE9Q414 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
ApobE9Q414 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
ApobE9Q414 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
ApobE9Q414 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
ApobE9Q414 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
ApobE9Q414 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
ApobE9Q414 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
ApobE9Q414 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
ApobE9Q414 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
ApobE9Q414 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
ApobE9Q414 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC8.2□□□□□ -1.1
ApobE9Q414 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC8.2□□□□□ -1.1
ApobE9Q414 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
ApobE9Q414 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
ApobE9Q414 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.2□□□□□ -1.1
ApobE9Q414 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
ApobE9Q414 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
ApobE9Q414 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.2□□□□□ -1.1
ApobE9Q414 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.1
ApobE9Q414 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
ApobE9Q414 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
ApobE9Q414 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
ApobE9Q414 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
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ApobE9Q414 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
ApobE9Q414 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
ApobE9Q414 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
ApobE9Q414 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
ApobE9Q414 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
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ApobE9Q414 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
ApobE9Q414 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
ApobE9Q414 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
ApobE9Q414 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
ApobE9Q414 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
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ApobE9Q414 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
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ApobE9Q414 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
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ApobE9Q414 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
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ApobE9Q414 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
ApobE9Q414 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
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ApobE9Q414 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.19□□□□□ -1.1
ApobE9Q414 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
ApobE9Q414 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC8.19□□□□□ -1.1
ApobE9Q414 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
ApobE9Q414 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
ApobE9Q414 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC8.19□□□□□ -1.1
ApobE9Q414 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC8.19□□□□□ -1.1
ApobE9Q414 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
ApobE9Q414 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC8.19□□□□□ -1.1
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ApobE9Q414 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
ApobE9Q414 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.19□□□□□ -1.1
ApobE9Q414 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
ApobE9Q414 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.19□□□□□ -1.1
ApobE9Q414 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
ApobE9Q414 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
ApobE9Q414 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.19□□□□□ -1.1
ApobE9Q414 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
ApobE9Q414 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.19□□□□□ -1.1
ApobE9Q414 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
ApobE9Q414 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
ApobE9Q414 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
ApobE9Q414 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC8.19□□□□□ -1.1
ApobE9Q414 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.19□□□□□ -1.1
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