Protein–RNA interactions for Protein: E9Q035

Gm20425, Predicted gene 20425, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 978 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20425E9Q035 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20425E9Q035 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20425E9Q035 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20425E9Q035 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20425E9Q035 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20425E9Q035 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20425E9Q035 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gm20425E9Q035 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20425E9Q035 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gm20425E9Q035 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20425E9Q035 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gm20425E9Q035 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20425E9Q035 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20425E9Q035 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20425E9Q035 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20425E9Q035 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20425E9Q035 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20425E9Q035 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gm20425E9Q035 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20425E9Q035 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20425E9Q035 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20425E9Q035 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20425E9Q035 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20425E9Q035 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20425E9Q035 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gm20425E9Q035 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20425E9Q035 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20425E9Q035 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20425E9Q035 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm20425E9Q035 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm20425E9Q035 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm20425E9Q035 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm20425E9Q035 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm20425E9Q035 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm20425E9Q035 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm20425E9Q035 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm20425E9Q035 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm20425E9Q035 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm20425E9Q035 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm20425E9Q035 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm20425E9Q035 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm20425E9Q035 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm20425E9Q035 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm20425E9Q035 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm20425E9Q035 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm20425E9Q035 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm20425E9Q035 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm20425E9Q035 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm20425E9Q035 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm20425E9Q035 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm20425E9Q035 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm20425E9Q035 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm20425E9Q035 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm20425E9Q035 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm20425E9Q035 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm20425E9Q035 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm20425E9Q035 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm20425E9Q035 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm20425E9Q035 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm20425E9Q035 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm20425E9Q035 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm20425E9Q035 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm20425E9Q035 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm20425E9Q035 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm20425E9Q035 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm20425E9Q035 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm20425E9Q035 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm20425E9Q035 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm20425E9Q035 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm20425E9Q035 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm20425E9Q035 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm20425E9Q035 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm20425E9Q035 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm20425E9Q035 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm20425E9Q035 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm20425E9Q035 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm20425E9Q035 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm20425E9Q035 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm20425E9Q035 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm20425E9Q035 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm20425E9Q035 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm20425E9Q035 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm20425E9Q035 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm20425E9Q035 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm20425E9Q035 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm20425E9Q035 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm20425E9Q035 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm20425E9Q035 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm20425E9Q035 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm20425E9Q035 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm20425E9Q035 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm20425E9Q035 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm20425E9Q035 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm20425E9Q035 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm20425E9Q035 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm20425E9Q035 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm20425E9Q035 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm20425E9Q035 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm20425E9Q035 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm20425E9Q035 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms