Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ddx60E9PZQ1 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ddx60E9PZQ1 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ddx60E9PZQ1 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ddx60E9PZQ1 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ddx60E9PZQ1 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Ddx60E9PZQ1 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ddx60E9PZQ1 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ddx60E9PZQ1 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms