Protein–RNA interactions for Protein: B4XVP9

Phf11c, PHD finger protein 11C, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11cB4XVP9 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Phf11cB4XVP9 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms