Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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PtprbB2RU80 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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PtprbB2RU80 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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PtprbB2RU80 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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PtprbB2RU80 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
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PtprbB2RU80 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms