Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2-M5A7VMS3 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2-M5A7VMS3 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2-M5A7VMS3 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2-M5A7VMS3 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2-M5A7VMS3 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2-M5A7VMS3 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2-M5A7VMS3 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2-M5A7VMS3 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2-M5A7VMS3 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2-M5A7VMS3 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2-M5A7VMS3 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2-M5A7VMS3 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2-M5A7VMS3 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
H2-M5A7VMS3 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2-M5A7VMS3 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
H2-M5A7VMS3 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2-M5A7VMS3 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2-M5A7VMS3 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2-M5A7VMS3 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2-M5A7VMS3 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2-M5A7VMS3 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2-M5A7VMS3 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2-M5A7VMS3 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
H2-M5A7VMS3 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
H2-M5A7VMS3 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2-M5A7VMS3 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2-M5A7VMS3 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2-M5A7VMS3 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
H2-M5A7VMS3 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2-M5A7VMS3 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2-M5A7VMS3 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2-M5A7VMS3 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2-M5A7VMS3 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2-M5A7VMS3 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
H2-M5A7VMS3 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2-M5A7VMS3 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2-M5A7VMS3 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2-M5A7VMS3 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2-M5A7VMS3 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2-M5A7VMS3 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
H2-M5A7VMS3 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
H2-M5A7VMS3 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
H2-M5A7VMS3 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
H2-M5A7VMS3 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
H2-M5A7VMS3 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
H2-M5A7VMS3 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
H2-M5A7VMS3 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
H2-M5A7VMS3 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
H2-M5A7VMS3 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
H2-M5A7VMS3 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
H2-M5A7VMS3 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
H2-M5A7VMS3 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
H2-M5A7VMS3 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2-M5A7VMS3 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms