Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm6880A3KG45 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm6880A3KG45 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm6880A3KG45 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm6880A3KG45 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm6880A3KG45 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm6880A3KG45 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm6880A3KG45 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Gm6880A3KG45 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm6880A3KG45 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Gm6880A3KG45 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm6880A3KG45 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm6880A3KG45 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Gm6880A3KG45 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Gm6880A3KG45 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm6880A3KG45 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm6880A3KG45 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Gm6880A3KG45 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Gm6880A3KG45 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm6880A3KG45 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm6880A3KG45 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm6880A3KG45 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm6880A3KG45 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Gm6880A3KG45 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm6880A3KG45 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm6880A3KG45 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm6880A3KG45 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm6880A3KG45 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm6880A3KG45 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm6880A3KG45 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm6880A3KG45 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm6880A3KG45 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Gm6880A3KG45 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm6880A3KG45 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm6880A3KG45 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm6880A3KG45 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm6880A3KG45 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Gm6880A3KG45 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Gm6880A3KG45 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm6880A3KG45 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm6880A3KG45 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm6880A3KG45 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm6880A3KG45 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm6880A3KG45 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm6880A3KG45 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm6880A3KG45 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm6880A3KG45 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm6880A3KG45 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm6880A3KG45 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm6880A3KG45 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm6880A3KG45 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm6880A3KG45 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm6880A3KG45 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm6880A3KG45 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm6880A3KG45 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm6880A3KG45 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm6880A3KG45 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm6880A3KG45 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm6880A3KG45 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm6880A3KG45 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm6880A3KG45 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gm6880A3KG45 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gm6880A3KG45 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gm6880A3KG45 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
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