Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scn3aA2ASI5 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms